RNA Pull-down
RNA（lncRNA、microRNA 等）pull-down 结合质谱（LC-MS）能高通量的筛选 RNA 的潜在互作蛋白，后续需要利 用 RNA pull-down 结合 western blot 进行验证，证明二者是真正的互作。
假定靶 RNA 与某个蛋白存在互作，则直接经 RNA pull-down 结合 WB 进行验证即可。
SM pull-down
SM（SmallMolecule）pull-down 结合质谱（LC-MS）能高通量的筛选 SM 的潜在靶点蛋白，后续需要利用 SM pull-down 结合 western blot 进行验证。
SM pull-down 结合 WB 验证阳性结果，是后续对 SM 作用的分子机理进行深入分析的绝对前提。
DNA pull-down
用 biotin 标记的 DNA 探针（Probe）与细胞核蛋白孵育，通过 streptavidin-beads 介导的 pull-down 富集 DNA 探针 的结合蛋白，然后用 western blot（WB）检测，验证 DNA 探针的特异性结合蛋白。
